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Structure primaire d'une protéine

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Structure primaire d'une protéine

En biochimie, la structure tertiaire ou tridimensionnelle est le repliement dans l'espace d'une chaîne polypeptidique. Ce repliement donne sa fonctionnalité à la protéine, notamment par la formation du site actif des enzymes. Au sein d’une structure d’hélice alpha qui présente bien dans les protéines fibreuses que dans les protéines globulaires, la chaîne des acides aminés prend la forme d'un tire-bouchon, Cette forme est le résultat de liaisons chimiques intramoléculaires. Courtoisie d'image: la structure primaire d'une protéine est linéaire et que la structure secondaire d'une protéine peut être une hélice a ou une feuille β, alors que la structure tertiaire d'une protéine est globulaire. Primaire, secondaire, tertiaire et quaternaire sont les quatre structures de protéines présentes dans la nature. Toutefois, une protéine ne garde jamais une forme strictement linéaire. L'energie contenue dans les liaisons hydrogéne, les ponts disulfures, l 'attraction entre les charges positives et négatives, et les radicaux hydrophobes ou hydrophiles, imposent à la protéine une structure secondaire en hélice alpha ou en feuillet bêta. Biochimie des protéines BCM514. On distingue quatre niveaux stades structuraux chez les protéines, de la structure primaire à la structure quaternaire. (1) Structure primaire: ordre des acides aminés le long de la chaîne polypeptidique. Par convention, la structure primaire d'une protéine est rapportée en partant de l' extrémité amino- terminale (N) jusqu'à l'extrémité carboxyl- terminale (C). Plusieurs protéines sont formées de l'assemblage de plusieurs chaînes d'acides aminés. C'est le cas, par exemple, de l' hémoglobine, la protéine des globules rouges qui transporte l'oxygène. L'hémoglobine est formée de deux chaînes dites alpha (identiques l'une à l'autre) et de deux chaînes dites bêta. À droite : surface moléculaire en contact avec le solvant colorée par type de résidu ( acide en rouge, basique en bleu, polaire en vert, apolaire en blanc). La nature des protéines est déterminée avant tout par leur séquence en acides aminés, qui constitue leur structure primaire. La structure primaire d'une protéine polypeptidique détermine ses structures secondaire, tertiaire et quaternaire. Structure primaire La structure primaire des polypeptides et des protéines est la séquence d'acides aminés dans la chaîne polypeptidique en référence aux emplacements de toutes les liaisons disulfure. La structure primaire d'une protéine est composée de liaisons peptidiques formées entre des acides aminés, la structure secondaire d'une protéine comprend des liaisons hydrogène, tandis que la structure tertiaire d'une protéine comprend des ponts disulfure, des ponts de sel et des liaisons hydrogène. La structure primaire d'une protéine est le fruit de la traduction de l'ARNm en séquence protéique par le ribosome. C'est grâce au code génétique que l'information génétique (sous forme d'ARN) est traduite en acides aminés. Structure primaire et variabilité des protéines La structure primaire des protéines est représentée par la séquence d’acides aminés (fig. 3) qui se lient de manière à former une chaîne polypeptidique. Figure 3 : Structure primaire d’une protéine. Mise en ordre des fragments obtenus: Il est intéressant de déterminer la structure primaire d'un peptide car cela permet d'anticiper sa fonction. Par exemple une succession d'AA hydrophobes suggère un possible encrage de ce peptide dans une membrane biologie. On peut également deviner un site actif enzymatique. BCM-514 Biochimie des protéines. Retour à la page d'accueil. La structure tertiaire d'une protéine fait référence à l'organisation dans l'espace de ses structures secondaires. La structure primaire correspond à la séquence en acides-aminés de la protéine. La structure secondaire est relative au premier niveau de compaction des protéines ; deux structures sont observées : les hélices α (alpha) et les feuillets β (bêta). La structure tertiaire correspond à la compaction des structures secondaires entre elles. Le niveau de base de la structure protéique, la structure primaire, consiste simplement en la séquence en acides aminés d'une chaîne polypeptidique. Par exemple, l'insuline possède deux chaînes polypeptidiques, A et B, représentées dans le schéma ci-dessous.

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